通過對雞舍及設備的清洗和消毒，可以清除雞舍及設備上的病原微生物，切斷各種病原微生物的傳播鏈，以確保上一群雞不對下一群雞造成健康和生產性能上的垂直影響。
清洗和消毒程序
程序的制定： 雞舍的清理、沖洗及消毒工作是一項復雜的系統工程，在種雞淘汰前，要制定一個科學、合理的清理、沖洗及消毒程序。制定程序時，一定要因地制宜，既全面、細致，又要考慮重點；既考慮集中性工作，又要考慮交叉性工作；盡可能減少重復性勞動，盡量避免交叉感染，最大限度減少設備的損壞和丟失。并根據任務的期限、人員的數量、工具的特性等科學、合理地安排整個清理、沖洗及消毒過程。
程序的實施
控制昆蟲： 昆蟲是疾病重要的傳播媒介，必須在其移居于木制品或其它物品之前，將其殺滅。當種雞淘汰后，這時雞舍還較溫暖，應該立即在墊料、雞舍設備和雞舍墻壁的表面噴灑殺蟲劑；或者選擇在種雞淘汰前兩周在雞舍使用殺蟲劑。第二次使用殺蟲劑應在熏蒸消毒前進行。
清掃灰塵： 所有的灰塵、碎屑和蜘蛛網必須從風機軸、房梁、開放式雞舍卷簾內側、雞舍內的凸處和墻角上清掃掉。最好用掃帚掃掉，這樣灰塵降落到墊料上。
預加濕： 在清理墊料和移出設備之前，應該對雞舍內部從雞舍頂部到地面用便攜式低壓噴霧器噴灑消毒劑，從而使塵埃潮濕沉降下來。在開放式雞舍，應先封閉卷簾。
移出設備： 所有的設備和設施（飲水器、料槽、棲息桿、產蛋箱、分隔欄等）應從雞舍內移出（注意，在移出產蛋箱之前，應事先將蛋窩內的墊料掏盡），并放在舍外的混凝土地面上。而不應把自動集蛋設施或雞舍不易移動的設備移到雞舍外。拆走溫控器、時間控制器、電壓調節器、風機電機、電燈泡等不易或不能沖洗消毒的物品，由專人（如電工）進行除塵、維護保養以及薰蒸消毒等，并放入指定的庫房進行隔離保管。
清除雞舍內糞便和墊料： 清除雞舍內所有的糞便、墊料和碎屑，拖車和垃圾車在移出雞舍前要遮蓋好，以免灰塵和碎屑在舍外被風吹的四處飄散，污染場區；離開雞舍時，車輪必須擦刷干凈并消毒。每清完一棟雞舍都要安排人員鏟刮棚架上、雞舍邊角以及其它表面所積累的糞便；并將該棟殘留的雞糞認真清掃干凈，同時，還要將雞舍周圍及其糞道撒落的雞糞也認真清掃干凈。糞便和墊料必須運往遠離雞場的地方，按當地規定進行處理。
雞舍內外的清洗： 必須首先斷開雞舍內所有電器設備的開關。用含有發泡劑的水通過高壓水槍沖洗，以清除殘留在雞舍和設備上的灰塵和碎屑。然后用含清洗劑的水進行擦洗。最后用有壓力的水沖干凈。在沖洗過程中，應迅速把雞舍內剩余的水排凈。所有移到雞舍外的設備必須浸泡和沖洗。在設備沖洗干凈后，設備應在有遮蓋物的條件下儲存。應特別注意雞舍內以下幾個部分的沖洗：風機框、風機軸、風機扇葉、通風設備的支架、屋梁的頂部、各種支架、水管等。雞舍外面也必須沖洗干凈并注意：進氣口、排水溝、水泥路面等部分的沖洗。為了確保難以接近的地方能沖洗干凈，可以使用輕便梯和手提式便攜燈。在開放式雞舍，卷簾內側和外側都必須沖洗干凈。任何不能沖洗的物品（如聚乙烯制品、紙板等）都必須銷毀。
飲水系統清洗： 排干水箱和水管內所有的水，用清水沖刷水線。清除水箱內的污物和水垢，并把這些物質排到雞舍外。在水箱內重新加入清水和水清潔劑。把含有清潔劑的水從水箱輸入到水線內。但注意不要出現氣阻現象。水箱內含清潔劑的水要保證適當的高度，這樣可以保證水管內的水有適當的壓力。更換水箱水時，要讓清潔劑在水箱內最少保留4小時。用清水沖刷并把水排掉。在進雞前重新加入清水。水管內易形成水垢，因此應經常進行處理，以避免影響水的流速和造成細菌污染。水垢和細菌中的脂肪多聚糖易形成苔蘚。水管所使用的材料，將影響到水垢形成的多少。例如：塑料水管和水箱，由于存在靜電特性從而易于細菌吸附，在飲水中使用維生素和礦物質易于形成水垢和其它物質的聚合。用物理方法很難去掉水管內的水垢，在兩批雞之間使用高濃度的次氯酸鈉或過氧化氫附和物可以溶解水管內的水垢。這需要在小雞飲水前把水管內的水垢徹底沖刷干凈。如果當地水中礦物質（特別是鈣或鐵）含量很高，在清洗中需要加一些酸，以便去除水垢。金屬水管也可采用同樣的清洗辦法。但有時水管腐蝕易造成漏水，在對飲水系統進行處理前，應考慮水中礦物質含量。
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飲水系統清洗液的配制比例及使用辦法
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| 清洗溶液 | 舍內無雞時 |
舍內有雞 |
| 混合清洗溶液，灌入飲水糸統并使溶液在糸統中貯放約4小時之后再用清水沖洗 |
可使用以下其中之一的溶液沖洗飲水糸統24小時。雞只可以飲用這些溶液 |
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| 醋（用于堿水） | 8ml／升 | 4m1．／升 |
| 檸檬酸（用于堿水） | 1.7mg／升 | 0.4mg／升 |
| 氨（用于酸性水） | 1.0ml／升 | 0.25m1．／升 |
蒸發冷卻系統和噴霧系統的清洗： 應使用雙硝酸清洗劑進行清洗，雙硝酸清洗劑也可以在產蛋期使用，這樣可以減少這些系統中的細菌數。并降低進入雞舍的細菌數量。
喂料系統的清洗： 清空、沖洗和消毒所有的喂料設施，如料箱、軌道、鏈條和懸掛料桶。清空料塔和連接管并打掃干凈，密封所有的開口。如可能可以進行熏蒸。
棚架的清洗： 竹制棚架、木制棚架、以及塑料棚架等，沖洗和消毒過程都基本相同。即，先將棚架縫隙殘留的雞糞盡可能鏟刮干凈，放入水池用清水浸泡，再用高壓水槍沖洗干凈，然后再放入配有消毒液的水池進行二次浸泡，最后用有壓力的水沖干凈。
其它設備的清洗： 其它設備（如產蛋箱、遮光罩等）的清洗消毒可參照以上介紹的辦法實施。
附屬設施的清洗： 凡在場區內的所有附屬設施，如洗衣房、浴室、廁所、蛋庫、料庫、草庫、鍋爐房、自行車棚、熏料間、熏蒸箱等，都要徹底沖洗干凈，同時，還應將各個地方的地漏、沉淀池等清理干凈。
雞舍的維修： 干凈的空雞舍為建筑結構的維修提供了理想的時機。雞舍一旦空置，應注意以下幾項工作：用混凝土或水泥修補地面上的裂縫。修補墻體的勾縫和粉刷的水泥層。修復或替換已損壞的墻體和屋頂。如需要用涂料或白石灰進行粉刷。確保雞舍所有的門都能關嚴。
設備的安裝和調試： 安裝并調試因沖洗需要而拆卸的設備，如溫控器、時間控制器、電壓調節器、風機電機、電燈泡等。
老鼠和野鳥的控制： 檢查所有進、出風口的防護網，若有損壞，及時修補；檢查所有門、窗是否能關嚴，需要時進行修理；檢查所有墻壁、擋板和屋頂上的縫隙，需要時要修補好。關閉所有門窗和進出風口，防止野鳥和鼠類動物進入雞舍。在雞舍內外投放鼠藥，此時老鼠已有數日無料可吃，很容易中毒（雞舍內的鼠藥在兩周后撤出）。
雞舍的消毒： 消毒應該在整棟雞舍（包括雞舍四周）徹底清洗干凈和維修完成后才能進行。消毒劑對污垢和有機物無效。在使用消毒劑時，必須按照消毒劑制造商的說明書進行使用。消毒劑應通過沖洗機或便攜式噴霧器來使用。對消毒劑進行發泡可以增加接觸時間，從而加強消毒效果。雞舍在密封后把溫度升到較高水平，將有助于增加消毒效果。
雞舍地面處理 若有必要，須對雞舍地面進行處理，如用：鹽、石灰、硼酸、硅酸鋁等。
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雞舍地面處理常用藥品
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| 成 份 | 用 量（kg/m2） | 目 的 |
| 硼 酸 | 必要時 | 殺滅黑黯甲蟲 |
| 硅酸鋁 | 必要時 | 殺滅黑黯甲蟲 |
| 鹽（氯化鈉） | 0.25 | 減少蛔蟲卵囊 |
| 干硫粉 | 0.01 | 地面消毒 |
| 石灰（碳酸鈣） | 必要時 |
堿性劑，用于地面消毒，便于打掃地面，并有助于墊料轉為肥料。 |
甲醛熏蒸： 如果允許使用甲醛熏蒸，在消毒結束后應立即進行熏蒸。熏蒸時，雞舍應保持潮濕，雞舍溫度應保持在21攝氏度。如果雞舍溫度過低，或相對濕度低于65%，熏蒸將是無效的。在熏蒸時，雞舍的門、風機、通風系統的格柵和窗戶必須嚴格密封。要按制造商說明書中介紹的方法進行，熏蒸后，雞舍必須封閉24小時，并設置醒目的“禁止入內”的標志牌。在人進入前必須徹底地進行通風。在雞舍墊料鋪放好后，上面所講的熏蒸程序應再進行一次。有關進一步詳情請參閱本地健康和衛生法規。這些法規應該一直貫徹執行。熏蒸對動物和人都是十分有害，操作者必須穿著防護衣。如必須戴防毒面罩、眼罩、手套。必須有兩個操作人員同時操作以應付緊急情況。
雞舍周圍環境的清掃： 雞舍周圍環境的清掃也十分重要。理想的情況下，雞舍四周應有3米寬的混凝土或沙礫地面。如果沒有，這些地區必須：清除周圍的植物，移走不使用的機器和設備，地面平整且水平，排水好，沒有積水。此外，還應特別注意清洗和消毒以下幾個地方：風機和排風扇的下面，進出道路，雞舍門周圍等。雞舍外的水泥地面應與雞舍內一樣進行沖洗消毒。
雞場沖洗和消毒效果的評估： 我們要了解雞舍的沖洗和消毒效果，及所花費的成本，其效果以總細菌數來評估。用總細菌數評估雞場清洗和消毒效果的好壞，將有利于改進雞場的衛生，并比較不同的沖洗和消毒效果。當雞場進行有效的消毒后，檢測程序中不應分離出沙門氏菌。
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雞場沖洗和消毒效果評估 |
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| 樣本位置 | 建議樣本數 | 總細菌數 | 沙門氏菌 | |
| 標準 | 最大量 | 無 | ||
| 支架 | 4 | 5 | 24 | 無 |
| 墻 | 4 | 5 | 24 | 無 |
| 地面 | 4 | 30 | 50 | 無 |
| 料箱 | 1 | 無 | ||
| 蛋箱 | 20 | 無 | ||
| 縫隙 | 2 | |||
| 排水溝 | 2 | |||
| * 每平方厘米總細菌數 | ||||
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家禽生產中常用的消毒藥 |
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消毒劑 |
濃度 |
用途 |
最佳效果 條件 |
殺滅 |
無效 |
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B |
F |
V |
S |
P |
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石灰 |
加水 |
石灰水 |
新鮮 |
+ |
+ |
+ |
－ |
－ |
孢子 |
|
堿水 |
2-5% |
混凝土地面 |
熱 |
+ |
+ |
+ |
－ |
－ |
|
|
季胺 |
0.02% 0.4-0.8% |
蛋 孵化設備和房舍 |
PH8 |
+ + |
+ + |
－ － |
－ － |
+ + |
受有機物質、肥皂和陰離子清潔劑的影響 |
|
甲（苯）酚 |
2-4% |
房舍 非金屬設備 腳盆 |
酸性、高溫 |
+ + + |
+ + + |
+ + － |
－ － － |
－ － － |
強烈的氣味，對雛雞有影響?；静皇苡袡C物質的影響。 |
|
石炭酸 |
0.05-1.0% |
房舍 非金屬設備 腳盆、孵化廳 |
PH2.6-10.4 |
+ + + |
+ + + |
+ － － |
－ － － |
－ － － |
孢子 |
|
碘附 |
0.00125－ 0.0025% 0.005－ 0.0075% |
飲水消毒 蛋 孵化廳 |
PH2－4 |
+ + + |
+ + + |
+ + + |
+ + － |
－ － － |
受有機物質的影響 |
|
氯 |
0.005% 0.02-5% |
0.0003%消毒種蛋， 孵化廳 |
酸性、高溫 |
+ + |
+ + |
+ + |
－ － |
－ － |
受有機物質的影響。有腐蝕性，孢子和 M.Avium無效 |
|
戊二醛 |
0.01% 0.15-2% |
建筑物 孵化廳 腳盆 |
PH7.5-8.5 |
+ + + |
+ + + |
+ + + |
+ + + |
－ － － |
干燥后無殘留效果。 帶有刺激性。 |
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福爾馬林 |
1-10% |
建筑物 孵化廳 腳盆 |
+ + + |
+ + + |
+ + + |
+ + － |
－ － － |
不受有機物質的影響 作用緩慢。 |
|
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福爾馬林 +7克 高錳酸鉀 |
14毫升 |
+ + |
+ + |
+ + |
+ + |
－ － |
受有機物質的影響。 |
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說明：B=細菌，F=真菌，V=病毒，S=孢子，P=原蟲
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家禽生產中常用的殺蟲劑 |
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活性成分 |
含量% |
物理*特性 |
殺滅對象 |
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氟氯氰菊酯 |
6－20 |
WP，EC，F |
蒼蠅、甲殼蟲、臭蟲、蟑螂、蜘蛛 |
|
甲奈威 |
10－80 |
F，B，WP |
甲殼蟲、虱子、臭蟲、螨 |
|
滅蠅胺 |
1－2 |
PM，F |
蒼蠅 |
|
氯氟氰菊酯 |
9.7－10 |
F，WP |
蒼蠅、甲殼蟲、臭蟲、蟑螂、蜘蛛 |
|
樂果 |
2 |
EC |
蒼蠅 |
|
氰戊菊酯 |
10 |
F |
蒼蠅、甲殼蟲、蜘蛛、蟑螂 |
|
馬拉硫磷 |
5－57 |
An，Pr |
蒼蠅、螨、臭蟲 |
|
滅多威 |
1 |
B |
蒼蠅 |
|
毒死蜱 |
20 |
F |
蒼蠅、甲殼蟲、蜘蛛、蟑螂 |
|
噻嗪 |
1 |
Strip |
蒼蠅 |
|
硼酸 |
30－99 |
WSP，B |
甲殼蟲 |
|
氯菊酯 |
0.25－30 |
D，EC，WP，RTU |
蟑螂、虱子、寄生蟲、蒼蠅、甲殼蟲、臭蟲 |
|
殺蟲畏 |
23 |
EC |
蒼蠅、甲殼蟲、虱子、螨 |
|
敵敵畏 |
1－40.2 |
RTU，EC |
蒼蠅、臭蟲 |
說明：B=餌料，D=粉料，EC=濃縮乳劑，F=懸浮液，PM=預混料，RTU=即開即用 WP=吸濕性粉劑，WSP=水溶性粉劑
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家禽生產中常用的滅鼠藥
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| 有效成分 | 餌料類型 |
| 溴鼠隆 | 一種抗凝血劑。每次投放2-3天后，因內出血而死亡。通常配制為顆粒狀滅鼠劑或適用于各種氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。 |
| 溴敵隆 |
一種抗凝血劑。每次投放2-3天后，因內出血而死亡。通常配制為顆粒狀滅鼠劑或適用于各種氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。 |
| 溴鼠胺 | 一種中央神經系統的毒藥。投放一次（若劑量大）2-3天內因代謝受阻而死亡。必要時投放兩到三次。通常為顆粒狀鼠藥。 |
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膽骨化醇，V D3 |
一種破壞代謝的毒藥。投放一次（若劑量大）2-3天內因代謝受阻而死亡。必要時投放兩到三次。通常為顆粒狀鼠藥。 |
| 氟鼠定 | 一種抗凝血劑。每次投放7天后，因內出血而死亡。通常為顆粒狀鼠藥。餌料含同類滅鼠有效成分的一半。 |
| 磷化鋅 | 一種劇毒藥物。每次投放或分撒后幾分鐘至幾小時內，因心臟衰竭或肝腸受損死亡。通常為與飼料混合成高濃度的顆粒。 |
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家禽生產中常用的滅鼠藥
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| 有效成分 | 餌料類型 |
| 氯鼠酮 | 復合型抗凝血劑。持續投放10-14天后，因內出血而導致死亡。通常為顆粒狀或適用于任何氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。 |
| 敵鼠 | 復合型抗凝血劑。持續投放10-14天后，因內出血而導致死亡。通常為顆粒狀或適用于任何氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。也可為液態濃縮裝。 |
| 異戊 | 復合型抗凝血劑。持續投放10-14天后，因內出血而導致死亡。只配制成低濃度粉藥。 |
| 鼠完 |
復合型抗凝血劑。持續投放10-14天后，因內出血而導致死亡。通常為顆粒狀或適用于任何氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。也可與飼料混合成高濃度的藥物。 |
| 滅鼠靈 | 復合型抗凝血劑。持續投放10-14天后，因內出血而導致死亡。通常為顆粒狀或適用于任何氣候條件下易于儲藏的蠟質包裝。也可與飼料混合成高濃度的藥物或低濃度粉藥。 |
